眼镜蛇组织虽核心人物落网，但白幽灵等骨干仍在。特种部队完成中东核危机任务后，突遭美国政府势力毁灭性打击，公爵等队员牺牲，仅拦路虎、杰伊小姐、弗林幸存。原来眼镜蛇已渗透美国高层，抹黑特种部队并栽赃蛇眼，目的是解救被囚的眼镜蛇指挥官，还伪装成美国总统掌控核武系统。幸存队员联合初代特种部队成员乔・科尔顿，揭露阴谋、救出真总统，阻止眼镜蛇的全球核武计划，为战友与部队正名。