承接第二季结局一年后，爆头女纽曼成立超人类事务局，黑袍小队转为政府编制，暂时和七人队停战休战。休伊进入机构当高管，屠夫成为外勤承包人，表面和平下双方都暗藏杀机。屠夫偶然得知俄国曾活捉初代超英士兵男孩，传说士兵男孩拥有能杀死祖国人的能力；为彻底除掉祖国人，屠夫、休伊远赴俄罗斯实验室，救出被囚禁数十年的士兵男孩。