托马斯率领林间斗士历经迷宫、丧尸考验后，为营救被 WCKD 抓走的米诺，筹划三年展开行动。营救失败后，他们闯入被称为 “最后之都” 的 WCKD 核心据点，联合曾背叛团队的特蕾莎，试图救出米诺与其他免疫者，揭开 WCKD 的终极阴谋，迎来系列最终的正邪对决。